Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cct7P80313 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cct7P80313 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cct7P80313 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct7P80313 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct7P80313 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct7P80313 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cct7P80313 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cct7P80313 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct7P80313 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cct7P80313 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cct7P80313 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct7P80313 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct7P80313 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cct7P80313 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cct7P80313 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cct7P80313 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cct7P80313 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cct7P80313 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cct7P80313 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cct7P80313 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms