Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf3P70671 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irf3P70671 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irf3P70671 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irf3P70671 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irf3P70671 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irf3P70671 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf3P70671 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf3P70671 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irf3P70671 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf3P70671 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf3P70671 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf3P70671 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf3P70671 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf3P70671 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf3P70671 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf3P70671 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Irf3P70671 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms