Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Rad50P70388 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rad50P70388 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rad50P70388 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rad50P70388 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rad50P70388 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Rad50P70388 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rad50P70388 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Rad50P70388 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,64■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Rad50P70388 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rad50P70388 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rad50P70388 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rad50P70388 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rad50P70388 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Rad50P70388 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Rad50P70388 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Rad50P70388 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Rad50P70388 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Rad50P70388 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,54■■■□□ 2
Rad50P70388 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Rad50P70388 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Rad50P70388 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rad50P70388 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rad50P70388 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rad50P70388 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rad50P70388 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Rad50P70388 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
Rad50P70388 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rad50P70388 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,51■■■□□ 2
Rad50P70388 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rad50P70388 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rad50P70388 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Rad50P70388 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Rad50P70388 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rad50P70388 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rad50P70388 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Rad50P70388 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Rad50P70388 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Rad50P70388 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Rad50P70388 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Rad50P70388 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Rad50P70388 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Rad50P70388 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Rad50P70388 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Rad50P70388 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Rad50P70388 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rad50P70388 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rad50P70388 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46,7 ms