Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad1P70340 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad1P70340 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad1P70340 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smad1P70340 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad1P70340 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad1P70340 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad1P70340 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad1P70340 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad1P70340 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad1P70340 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad1P70340 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad1P70340 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad1P70340 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad1P70340 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad1P70340 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad1P70340 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad1P70340 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad1P70340 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad1P70340 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms