Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp7P70280 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vamp7P70280 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vamp7P70280 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp7P70280 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms