Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad54lP70270 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad54lP70270 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad54lP70270 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad54lP70270 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad54lP70270 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad54lP70270 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad54lP70270 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms