Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrig1P70193 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrig1P70193 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrig1P70193 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrig1P70193 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms