Protein–RNA interactions for Protein: P70158

Smpdl3a, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3aP70158 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpdl3aP70158 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpdl3aP70158 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpdl3aP70158 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpdl3aP70158 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpdl3aP70158 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpdl3aP70158 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpdl3aP70158 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpdl3aP70158 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpdl3aP70158 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smpdl3aP70158 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smpdl3aP70158 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms