Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcbP68404 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcbP68404 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcbP68404 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkcbP68404 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkcbP68404 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrkcbP68404 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkcbP68404 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkcbP68404 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkcbP68404 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms