Protein–RNA interactions for Protein: P63280

Ube2i, SUMO-conjugating enzyme UBC9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2iP63280 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2iP63280 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2iP63280 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Ube2iP63280 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2iP63280 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms