Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crip1P63254 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crip1P63254 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crip1P63254 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crip1P63254 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crip1P63254 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crip1P63254 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crip1P63254 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crip1P63254 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crip1P63254 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms