Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hmgb1P63158 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgb1P63158 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgb1P63158 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms