Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2bP62915 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2bP62915 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf2bP62915 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2bP62915 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2bP62915 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf2bP62915 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2bP62915 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2bP62915 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2bP62915 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2bP62915 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2bP62915 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2bP62915 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2bP62915 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms