Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ElobP62869 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ElobP62869 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ElobP62869 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ElobP62869 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ElobP62869 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ElobP62869 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ElobP62869 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ElobP62869 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ElobP62869 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ElobP62869 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ElobP62869 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ElobP62869 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ElobP62869 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ElobP62869 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ElobP62869 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ElobP62869 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ElobP62869 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ElobP62869 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ElobP62869 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ElobP62869 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ElobP62869 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ElobP62869 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ElobP62869 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ElobP62869 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ElobP62869 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ElobP62869 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ElobP62869 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ElobP62869 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ElobP62869 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ElobP62869 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ElobP62869 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ElobP62869 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ElobP62869 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ElobP62869 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ElobP62869 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ElobP62869 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ElobP62869 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ElobP62869 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ElobP62869 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ElobP62869 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ElobP62869 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ElobP62869 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ElobP62869 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ElobP62869 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ElobP62869 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ElobP62869 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ElobP62869 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ElobP62869 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ElobP62869 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ElobP62869 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ElobP62869 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ElobP62869 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ElobP62869 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ElobP62869 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ElobP62869 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ElobP62869 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ElobP62869 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ElobP62869 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ElobP62869 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ElobP62869 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ElobP62869 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ElobP62869 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ElobP62869 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ElobP62869 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ElobP62869 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ElobP62869 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ElobP62869 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ElobP62869 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ElobP62869 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ElobP62869 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ElobP62869 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ElobP62869 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ElobP62869 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ElobP62869 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ElobP62869 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ElobP62869 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ElobP62869 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ElobP62869 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ElobP62869 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ElobP62869 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ElobP62869 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ElobP62869 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ElobP62869 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ElobP62869 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ElobP62869 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ElobP62869 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms