Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,89□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,88□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,88□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,88□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,88□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,88□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,88□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,87□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,87□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,87□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,87□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13,86□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,86□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,86□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13,86□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,86□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13,86□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC13,85□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,85□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,85□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,85□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,85□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,85□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,85□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,84□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,84□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13,84□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13,84□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,84□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,84□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13,84□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,83□□□□□ -0,19
Rps28P62858 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,82□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13,82□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,82□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,82□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC13,82□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,82□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13,81□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13,81□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,81□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,81□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,81□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,8□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,8□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,8□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13,8□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13,8□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,8□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,79□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,79□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,79□□□□□ -0,2
Rps28P62858 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,79□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,79□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC13,79□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,78□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13,78□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13,78□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,78□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,78□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,78□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,78□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13,78□□□□□ -0,2
Rps28P62858 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,77□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC13,77□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,77□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13,77□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13,77□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,77□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,77□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,77□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,76□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,75□□□□□ -0,21
Rps28P62858 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,75□□□□□ -0,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms