Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psmc6P62334 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psmc6P62334 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psmc6P62334 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psmc6P62334 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmc6P62334 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmc6P62334 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmc6P62334 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psmc6P62334 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Psmc6P62334 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Psmc6P62334 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Psmc6P62334 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Psmc6P62334 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms