Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d1P61080 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d1P61080 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms