Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sf3b6P59708 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3b6P59708 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b6P59708 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3b6P59708 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms