Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ripk2P58801 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ripk2P58801 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ripk2P58801 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ripk2P58801 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ripk2P58801 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ripk2P58801 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk2P58801 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk2P58801 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ripk2P58801 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms