Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp1P58466 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp1P58466 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms