Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtpaP58389 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpaP58389 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpaP58389 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpaP58389 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpaP58389 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpaP58389 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpaP58389 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtpaP58389 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtpaP58389 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtpaP58389 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpaP58389 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpaP58389 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtpaP58389 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtpaP58389 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms