Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cox17P56394 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cox17P56394 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox17P56394 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox17P56394 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cox17P56394 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox17P56394 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox17P56394 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox17P56394 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox17P56394 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox17P56394 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox17P56394 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox17P56394 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox17P56394 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox17P56394 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox17P56394 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cox17P56394 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cox17P56394 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.9 ms