Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5g3P56384 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5g3P56384 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5g3P56384 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5g3P56384 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms