Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nub1P54729 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nub1P54729 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nub1P54729 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nub1P54729 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nub1P54729 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nub1P54729 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nub1P54729 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nub1P54729 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nub1P54729 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nub1P54729 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nub1P54729 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nub1P54729 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nub1P54729 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nub1P54729 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nub1P54729 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms