Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2e3P52483 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2e3P52483 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2e3P52483 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2e3P52483 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2e3P52483 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ube2e3P52483 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2e3P52483 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2e3P52483 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms