Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdkn1cP49919 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdkn1cP49919 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkn1cP49919 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkn1cP49919 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkn1cP49919 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms