Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpcP49452 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpcP49452 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpcP49452 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpcP49452 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpcP49452 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpcP49452 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpcP49452 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpcP49452 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpcP49452 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpcP49452 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpcP49452 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpcP49452 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpcP49452 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CenpcP49452 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpcP49452 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpcP49452 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpcP49452 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpcP49452 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms