Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurod6P48986 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Neurod6P48986 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Neurod6P48986 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Neurod6P48986 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Neurod6P48986 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Neurod6P48986 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Neurod6P48986 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms