Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptx3P48759 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptx3P48759 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptx3P48759 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptx3P48759 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptx3P48759 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptx3P48759 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptx3P48759 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptx3P48759 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptx3P48759 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptx3P48759 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptx3P48759 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptx3P48759 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptx3P48759 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptx3P48759 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ptx3P48759 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptx3P48759 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptx3P48759 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms