Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PcntP48725 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PcntP48725 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PcntP48725 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PcntP48725 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PcntP48725 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PcntP48725 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PcntP48725 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PcntP48725 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PcntP48725 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PcntP48725 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PcntP48725 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PcntP48725 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PcntP48725 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PcntP48725 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PcntP48725 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PcntP48725 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PcntP48725 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PcntP48725 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PcntP48725 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PcntP48725 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PcntP48725 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PcntP48725 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PcntP48725 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcntP48725 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcntP48725 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcntP48725 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PcntP48725 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PcntP48725 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PcntP48725 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PcntP48725 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PcntP48725 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PcntP48725 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcntP48725 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcntP48725 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcntP48725 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PcntP48725 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PcntP48725 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PcntP48725 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PcntP48725 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PcntP48725 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PcntP48725 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PcntP48725 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PcntP48725 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PcntP48725 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PcntP48725 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcntP48725 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcntP48725 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcntP48725 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PcntP48725 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PcntP48725 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PcntP48725 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcntP48725 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcntP48725 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcntP48725 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PcntP48725 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcntP48725 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcntP48725 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PcntP48725 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PcntP48725 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcntP48725 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcntP48725 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcntP48725 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PcntP48725 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PcntP48725 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms