Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Abcd1P48410 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Abcd1P48410 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Abcd1P48410 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Abcd1P48410 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Abcd1P48410 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Abcd1P48410 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44,4 ms