Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VdrP48281 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VdrP48281 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VdrP48281 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VdrP48281 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VdrP48281 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VdrP48281 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VdrP48281 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VdrP48281 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VdrP48281 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VdrP48281 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VdrP48281 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VdrP48281 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VdrP48281 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VdrP48281 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VdrP48281 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VdrP48281 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VdrP48281 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VdrP48281 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VdrP48281 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VdrP48281 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VdrP48281 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VdrP48281 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VdrP48281 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VdrP48281 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VdrP48281 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VdrP48281 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VdrP48281 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VdrP48281 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VdrP48281 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VdrP48281 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VdrP48281 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VdrP48281 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VdrP48281 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VdrP48281 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VdrP48281 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VdrP48281 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VdrP48281 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VdrP48281 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VdrP48281 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VdrP48281 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VdrP48281 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VdrP48281 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VdrP48281 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VdrP48281 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VdrP48281 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VdrP48281 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VdrP48281 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VdrP48281 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VdrP48281 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VdrP48281 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VdrP48281 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VdrP48281 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VdrP48281 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VdrP48281 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VdrP48281 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VdrP48281 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VdrP48281 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VdrP48281 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VdrP48281 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VdrP48281 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VdrP48281 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VdrP48281 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VdrP48281 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VdrP48281 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VdrP48281 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VdrP48281 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VdrP48281 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VdrP48281 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VdrP48281 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VdrP48281 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VdrP48281 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VdrP48281 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VdrP48281 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VdrP48281 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VdrP48281 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VdrP48281 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VdrP48281 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VdrP48281 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VdrP48281 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VdrP48281 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VdrP48281 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VdrP48281 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VdrP48281 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VdrP48281 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VdrP48281 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VdrP48281 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VdrP48281 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VdrP48281 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VdrP48281 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VdrP48281 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VdrP48281 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VdrP48281 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VdrP48281 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VdrP48281 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VdrP48281 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VdrP48281 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VdrP48281 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VdrP48281 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VdrP48281 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms