Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbx2P48031 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbx2P48031 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbx2P48031 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbx2P48031 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbx2P48031 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx2P48031 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx2P48031 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx2P48031 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx2P48031 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx2P48031 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx2P48031 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx2P48031 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx2P48031 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbx2P48031 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx2P48031 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx2P48031 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx2P48031 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx2P48031 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx2P48031 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx2P48031 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbx2P48031 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx2P48031 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx2P48031 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx2P48031 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx2P48031 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx2P48031 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx2P48031 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbx2P48031 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbx2P48031 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbx2P48031 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbx2P48031 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbx2P48031 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbx2P48031 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms