Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpl13P47963 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpl13P47963 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rpl13P47963 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpl13P47963 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl13P47963 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.5 ms