Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfrsf4P47741 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfrsf4P47741 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf4P47741 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfrsf4P47741 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf4P47741 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf4P47741 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf4P47741 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf4P47741 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf4P47741 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf4P47741 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf4P47741 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms