Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlx1P43345 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlx1P43345 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tlx1P43345 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tlx1P43345 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tlx1P43345 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms