Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gdf6P43028 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf6P43028 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf6P43028 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf6P43028 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf6P43028 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms