Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nkx1-2P42580 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nkx1-2P42580 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nkx1-2P42580 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nkx1-2P42580 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx1-2P42580 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nkx1-2P42580 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms