Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TtlP38585 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TtlP38585 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TtlP38585 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TtlP38585 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TtlP38585 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TtlP38585 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TtlP38585 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TtlP38585 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TtlP38585 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TtlP38585 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TtlP38585 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TtlP38585 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TtlP38585 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TtlP38585 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TtlP38585 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TtlP38585 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TtlP38585 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TtlP38585 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TtlP38585 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TtlP38585 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TtlP38585 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TtlP38585 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TtlP38585 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TtlP38585 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TtlP38585 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TtlP38585 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TtlP38585 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TtlP38585 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TtlP38585 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TtlP38585 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TtlP38585 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TtlP38585 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TtlP38585 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TtlP38585 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TtlP38585 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TtlP38585 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TtlP38585 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TtlP38585 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TtlP38585 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TtlP38585 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TtlP38585 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TtlP38585 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TtlP38585 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TtlP38585 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TtlP38585 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TtlP38585 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TtlP38585 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TtlP38585 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TtlP38585 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TtlP38585 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TtlP38585 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TtlP38585 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TtlP38585 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TtlP38585 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TtlP38585 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TtlP38585 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TtlP38585 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TtlP38585 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TtlP38585 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TtlP38585 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TtlP38585 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TtlP38585 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TtlP38585 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TtlP38585 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TtlP38585 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TtlP38585 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TtlP38585 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TtlP38585 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TtlP38585 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TtlP38585 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TtlP38585 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TtlP38585 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TtlP38585 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TtlP38585 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TtlP38585 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TtlP38585 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TtlP38585 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TtlP38585 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TtlP38585 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TtlP38585 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TtlP38585 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TtlP38585 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TtlP38585 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TtlP38585 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TtlP38585 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TtlP38585 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TtlP38585 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TtlP38585 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TtlP38585 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TtlP38585 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TtlP38585 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TtlP38585 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TtlP38585 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TtlP38585 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TtlP38585 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TtlP38585 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TtlP38585 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TtlP38585 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TtlP38585 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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