Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmgclP38060 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmgclP38060 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmgclP38060 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmgclP38060 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmgclP38060 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmgclP38060 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmgclP38060 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmgclP38060 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmgclP38060 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmgclP38060 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmgclP38060 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HmgclP38060 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HmgclP38060 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HmgclP38060 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmgclP38060 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HmgclP38060 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HmgclP38060 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HmgclP38060 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgclP38060 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgclP38060 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgclP38060 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HmgclP38060 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HmgclP38060 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgclP38060 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgclP38060 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgclP38060 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HmgclP38060 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms