Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab17P35292 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab17P35292 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab17P35292 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab17P35292 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rab17P35292 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab17P35292 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab17P35292 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab17P35292 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab17P35292 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 648.1 ms