Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apoc3P33622 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc3P33622 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc3P33622 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apoc3P33622 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc3P33622 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms