Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd1P33215 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd1P33215 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nedd1P33215 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nedd1P33215 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd1P33215 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms