Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd8P29595 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd8P29595 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd8P29595 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd8P29595 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd8P29595 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd8P29595 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd8P29595 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nedd8P29595 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd8P29595 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd8P29595 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd8P29595 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nedd8P29595 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd8P29595 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd8P29595 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd8P29595 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nedd8P29595 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nedd8P29595 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nedd8P29595 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nedd8P29595 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms