Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprmP28828 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtprmP28828 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprmP28828 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprmP28828 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprmP28828 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprmP28828 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprmP28828 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprmP28828 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprmP28828 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprmP28828 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprmP28828 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprmP28828 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
PtprmP28828 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprmP28828 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprmP28828 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprmP28828 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprmP28828 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprmP28828 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprmP28828 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PtprmP28828 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PtprmP28828 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PtprmP28828 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtprmP28828 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprmP28828 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PtprmP28828 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PtprmP28828 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprmP28828 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprmP28828 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms