Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex1P28352 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apex1P28352 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apex1P28352 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apex1P28352 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apex1P28352 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apex1P28352 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apex1P28352 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apex1P28352 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apex1P28352 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apex1P28352 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apex1P28352 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apex1P28352 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms