Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aco1P28271 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aco1P28271 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aco1P28271 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aco1P28271 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aco1P28271 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aco1P28271 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Aco1P28271 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aco1P28271 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aco1P28271 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aco1P28271 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aco1P28271 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aco1P28271 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Aco1P28271 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms