Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vav1P27870 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vav1P27870 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vav1P27870 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vav1P27870 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vav1P27870 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vav1P27870 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vav1P27870 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vav1P27870 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vav1P27870 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav1P27870 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav1P27870 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav1P27870 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav1P27870 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav1P27870 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vav1P27870 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vav1P27870 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vav1P27870 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vav1P27870 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav1P27870 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vav1P27870 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vav1P27870 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vav1P27870 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms