Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl3P27659 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl3P27659 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpl3P27659 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl3P27659 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl3P27659 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl3P27659 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl3P27659 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms