Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SarsP26638 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SarsP26638 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SarsP26638 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SarsP26638 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SarsP26638 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SarsP26638 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SarsP26638 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SarsP26638 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SarsP26638 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SarsP26638 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SarsP26638 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SarsP26638 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SarsP26638 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SarsP26638 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SarsP26638 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SarsP26638 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SarsP26638 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SarsP26638 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SarsP26638 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SarsP26638 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SarsP26638 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SarsP26638 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SarsP26638 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SarsP26638 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SarsP26638 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SarsP26638 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SarsP26638 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SarsP26638 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SarsP26638 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SarsP26638 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SarsP26638 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SarsP26638 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SarsP26638 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SarsP26638 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SarsP26638 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SarsP26638 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SarsP26638 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SarsP26638 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SarsP26638 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SarsP26638 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SarsP26638 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SarsP26638 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SarsP26638 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SarsP26638 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SarsP26638 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SarsP26638 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SarsP26638 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SarsP26638 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SarsP26638 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SarsP26638 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SarsP26638 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SarsP26638 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SarsP26638 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SarsP26638 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SarsP26638 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SarsP26638 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SarsP26638 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SarsP26638 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SarsP26638 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SarsP26638 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SarsP26638 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SarsP26638 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SarsP26638 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SarsP26638 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SarsP26638 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SarsP26638 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SarsP26638 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SarsP26638 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SarsP26638 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SarsP26638 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SarsP26638 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SarsP26638 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SarsP26638 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SarsP26638 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SarsP26638 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SarsP26638 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SarsP26638 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SarsP26638 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SarsP26638 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SarsP26638 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SarsP26638 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SarsP26638 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SarsP26638 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SarsP26638 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SarsP26638 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SarsP26638 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SarsP26638 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SarsP26638 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SarsP26638 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SarsP26638 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SarsP26638 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SarsP26638 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SarsP26638 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SarsP26638 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SarsP26638 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SarsP26638 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SarsP26638 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SarsP26638 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SarsP26638 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms